20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1439 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  53.91 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  58.01 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  49.8 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  32.41 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  32.35 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  33.06 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  31.41 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  32.34 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  30.42 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  29.66 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  25.31 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  30.34 
 
 		 407 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  31.48 
 
 		 405 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  38.89 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  29.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  28.33 
 
 		 395 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  37.66 
 
 		 332 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  29.87 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  36.75 
 
 		 333 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>