More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0557 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  46.07 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.36 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000965249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  37.67 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 286 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  31.32 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  30.12 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.1 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  36.28 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.56 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.33 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.12 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.19 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1433  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0017  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.66 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.25 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.83 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2150  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.301161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 624 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1330  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.3 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.283996  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.91 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  27.4 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.94 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  30.3 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4785  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 424 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.06 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2392  hypothetical protein  25.6 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.823369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.74 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.66 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.2 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.19 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  30.51 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.03 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 1002 aa  62.4  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.67 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.93 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 275 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 285 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 1000 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>