More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0503 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 453 aa  918    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  79.46 
 
 		 449 aa  707    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  79.65 
 
 		 450 aa  725    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  56.17 
 
 		 447 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  56.19 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  54.46 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  53.78 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0847  hypothetical protein  50.35 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  hitchhiker  0.000695829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  42.42 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  45.48 
 
 		 438 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  44.65 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  44.42 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  42.43 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  42.43 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  42.73 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  41.3 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  50.79 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  41.71 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  38.98 
 
 		 442 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  40.7 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  39.1 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  38.1 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  37.86 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  37.73 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  37.96 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.77 
 
 		 442 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.16 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  43.83 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  38.28 
 
 		 437 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.42 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  35.41 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  37.27 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  34.93 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  34.64 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  36.24 
 
 		 455 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  32.72 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.64 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  33.49 
 
 		 427 aa  262  8.999999999999999e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  34.57 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  34.41 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  34.41 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1278  hypothetical protein  44.13 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00305135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  32.49 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.65 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  34.11 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  34.18 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  33.1 
 
 		 442 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.86 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.86 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  33.1 
 
 		 442 aa  259  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.86 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  32.63 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  36.53 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  33.72 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  36.09 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 		 443 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  32.72 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  33.8 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1719  protein of unknown function DUF21  35.98 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.444984  normal  0.388918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2061  CBS domain protein  35.98 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.26 
 
 		 448 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  34.41 
 
 		 446 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  35.92 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  31.79 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6830  protein of unknown function DUF21  35.81 
 
 		 447 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0646  hypothetical protein  32.33 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  36.45 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.93 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  34.98 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 		 361 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 		 361 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.32 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  31.15 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.84 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  34.74 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  30.86 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  30.86 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  30.86 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  30.86 
 
 		 435 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  34.11 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4513  hypothetical protein  34.4 
 
 		 447 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3851  hypothetical protein  34.4 
 
 		 447 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3676  hypothetical protein  34.4 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0399185  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  34.13 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 		 442 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.66 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30.56 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>