More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2600 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1869  serine/threonine protein kinase  85.69 
 
 
641 aa  1109    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2600  protein kinase  100 
 
 
629 aa  1283    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212031  normal  0.220118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3720  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
636 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00169428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1720  serine/threonine protein kinase  48.33 
 
 
632 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314781  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4117  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 
667 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3305  protein kinase  29.62 
 
 
690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3164  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 
682 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00493454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.58 
 
 
627 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.96 
 
 
863 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.7 
 
 
880 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.92 
 
 
584 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.22 
 
 
638 aa  135  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  34.23 
 
 
604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
666 aa  134  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.94 
 
 
627 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
612 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
707 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.27 
 
 
579 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
703 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  32.96 
 
 
889 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
554 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
612 aa  126  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
776 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
502 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.71 
 
 
650 aa  124  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 
646 aa  124  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.27 
 
 
715 aa  123  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.59 
 
 
625 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.6 
 
 
505 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 
632 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.68 
 
 
621 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.99 
 
 
1183 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 
444 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 
673 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
468 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.32 
 
 
662 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 
349 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.35 
 
 
692 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  32.29 
 
 
1018 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.72 
 
 
602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  34.73 
 
 
503 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  31.34 
 
 
618 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
465 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
783 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
368 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.31 
 
 
528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  29.02 
 
 
457 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
569 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  30.66 
 
 
1032 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  33.84 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
569 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
746 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
651 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0217  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 
353 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00807707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0240  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 
353 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.31 
 
 
614 aa  113  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0229  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 
353 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.32 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3401  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.25 
 
 
916 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.82 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  31.5 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.37 
 
 
696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
761 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
596 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
439 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  30.29 
 
 
1032 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.06 
 
 
668 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.91 
 
 
641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
618 aa  111  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.8 
 
 
647 aa  111  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.11 
 
 
700 aa  111  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.66 
 
 
517 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.92 
 
 
594 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  32.16 
 
 
477 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.83 
 
 
603 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
464 aa  110  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
641 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
615 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  37.56 
 
 
559 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.66 
 
 
896 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  31.8 
 
 
623 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
625 aa  109  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.32 
 
 
591 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0395  serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 
420 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  31.29 
 
 
583 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
1122 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.55 
 
 
652 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  30.68 
 
 
484 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
651 aa  108  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.28 
 
 
634 aa  108  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 
498 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>