43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5577 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  72.28 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  55.34 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  51.92 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  51.92 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  48.57 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  41.35 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  40.78 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  37.86 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  40.78 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  36.19 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  35.92 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  35.92 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  43.37 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  43.37 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  37.86 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  37.86 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  36.63 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  37.62 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  37.62 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  37.62 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  37.62 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  35.85 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  34.91 
 
 		 273 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  34.91 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  30.69 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  31.76 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  30.38 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  31.71 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  29.27 
 
 		 113 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  30 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  30.38 
 
 		 114 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  27.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>