41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5186 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3324  Ion transport 2 domain protein  32.22 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.471998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  26.15 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  31.55 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  32.2 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  27.11 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  31.53 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  26.81 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  31.48 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  33.68 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  33.68 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  31.86 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  30 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  33.05 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  31.39 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  30 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  31.37 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  36.63 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  36 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  26.27 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  27.34 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  52.08 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  30.51 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  28.47 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  29.56 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  47.92 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2107  hypothetical protein  27.41 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.46407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  32.26 
 
 		 102 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  26.54 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  25.47 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  49.06 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 251 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  45.28 
 
 		 258 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  38 
 
 		 282 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  40.48 
 
 		 269 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  31.73 
 
 		 304 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>