19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4552 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  100 
 
 		 852 aa  1732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  34.32 
 
 		 995 aa  208  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  30.79 
 
 		 957 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  31.17 
 
 		 692 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  31.05 
 
 		 374 aa  80.9  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  30.12 
 
 		 777 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  30.47 
 
 		 226 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  29.78 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  30.09 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  30.09 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  30.09 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.68 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  27.27 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  27.27 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  27.27 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  46.97 
 
 		 544 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  35.79 
 
 		 173 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  36.11 
 
 		 511 aa  53.9  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  25.48 
 
 		 516 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>