207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4199 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  73.68 
 
 		 281 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  69.06 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  64.84 
 
 		 273 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  64.84 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  64.84 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  64.47 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  63.74 
 
 		 273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  63.74 
 
 		 273 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  62.92 
 
 		 275 aa  331  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  61.99 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  64.29 
 
 		 275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  63.53 
 
 		 278 aa  324  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  62.03 
 
 		 275 aa  321  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  51.7 
 
 		 279 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  45.77 
 
 		 261 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  44.71 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  46.56 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  44.84 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  44.83 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  44.44 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  43.68 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  42.59 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  43.08 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  43.6 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  42.47 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.08 
 
 		 256 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  43.82 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  40.82 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  41.13 
 
 		 617 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  40.77 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.15 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  41.56 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  41.54 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  41.15 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  42.8 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  40.86 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  41.73 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  42.51 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  40.24 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  42.31 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  41.6 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  38.18 
 
 		 623 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  40.96 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  39.44 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  39.04 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3400  siderophore-interacting protein  40.32 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.98 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3570  siderophore-interacting protein  38.34 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3508  siderophore-interacting protein  38.34 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000266465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3474  siderophore-interacting protein  39.92 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  38.87 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3404  siderophore-interacting protein  39.92 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  38.27 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.52 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  39 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  39.15 
 
 		 361 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  39.1 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  38.31 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.27 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  38.31 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.4 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  35.71 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.59 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.24 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.85 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  38.02 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  40.08 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  35.91 
 
 		 340 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  34.88 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  40.82 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  35.92 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  37.94 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.84 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.71 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  40.41 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.57 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.57 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  35.97 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.57 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  37.11 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  36.36 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.89 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.97 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.18 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  35.97 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  35.18 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  34.69 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>