23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1746 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1746  putative transposase protein  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.318345  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  64.71 
 
 		 491 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  58.54 
 
 		 468 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  58.54 
 
 		 468 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  52.38 
 
 		 462 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  56.76 
 
 		 464 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  56.76 
 
 		 464 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 496 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 496 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 431 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 417 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  46 
 
 		 432 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  54.05 
 
 		 496 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  54.05 
 
 		 496 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  38.46 
 
 		 445 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 477 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  51.35 
 
 		 494 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  43.18 
 
 		 468 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  32.69 
 
 		 432 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 475 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 475 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  35.29 
 
 		 475 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  30.77 
 
 		 432 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>