28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1740 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  72.01 
 
 		 443 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  905    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  58.37 
 
 		 521 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  60.55 
 
 		 519 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  58.14 
 
 		 521 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  58.37 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  60.3 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  60.05 
 
 		 478 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4269  hypothetical protein  30.58 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  26.38 
 
 		 489 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  26 
 
 		 582 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  25.94 
 
 		 584 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  25.94 
 
 		 584 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  24.93 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  21.19 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  19.78 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  21.07 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  23.91 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.35 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  26.34 
 
 		 720 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  21.48 
 
 		 410 aa  46.6  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  22.3 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  22.3 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  23.12 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  22.94 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.51 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  25.67 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>