33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0209 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0252  hypothetical protein  58.56 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3626  hypothetical protein  45.57 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4703  hypothetical protein  45.57 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0549  hypothetical protein  45.95 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0514005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2167  hypothetical protein  45.76 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0811  hypothetical protein  45.76 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0487104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0903  hypothetical protein  45.76 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.614601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3185  hypothetical protein  37.84 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0257784 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1810  hypothetical protein  44.07 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0760  hypothetical protein  35.44 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668684  normal  0.055839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2453  hypothetical protein  41.27 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2583  hypothetical protein  41.27 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.100302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.593029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5866  hypothetical protein  32.91 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665282  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2559  hypothetical protein  35.48 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0468  hypothetical protein  37.93 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1923  hypothetical protein  34.41 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2535  hypothetical protein  34.41 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00615729  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3395  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3646  hypothetical protein  34.52 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.849492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5314  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626563  normal  0.120067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0706  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4972  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4184  hypothetical protein  37.18 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4394  hypothetical protein  37.04 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0437528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4913  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0705  hypothetical protein  36.21 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0384  hypothetical protein  34.72 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829931  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5923  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>