78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2682 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 		 505 aa  1023    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  57.52 
 
 		 499 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  55.69 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  56.49 
 
 		 512 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  55.9 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  55.83 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  54.85 
 
 		 487 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  54.53 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  51.07 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50.85 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  51.31 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  49.89 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.48 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  45.57 
 
 		 475 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  48.84 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.92 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.9 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.03 
 
 		 469 aa  372  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  44.94 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  50.69 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  45.01 
 
 		 476 aa  357  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  44.28 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  45.03 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  45.03 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  45.03 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.42 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  43.67 
 
 		 475 aa  345  7e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  47.37 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  48.75 
 
 		 463 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  44.12 
 
 		 507 aa  342  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  43.7 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  42.03 
 
 		 462 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  48.15 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  42.95 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.52 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  43.22 
 
 		 460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  46.68 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  50.42 
 
 		 464 aa  326  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.53 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  27.73 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  27.73 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  29.53 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  27.31 
 
 		 334 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.78 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.78 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  25.81 
 
 		 669 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.45 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  27.89 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  24.34 
 
 		 660 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  25.84 
 
 		 304 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.02 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  30.7 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  22.69 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  22.69 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  27.27 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.9 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.48 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.84 
 
 		 678 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  22.63 
 
 		 337 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.6 
 
 		 672 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.59 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  26.06 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  22.63 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  22.6 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  21.81 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  26.25 
 
 		 365 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.24 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  23.36 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.18 
 
 		 340 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.13 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.32 
 
 		 362 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  23.68 
 
 		 337 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1407  Mg chelatase, subunit ChlI  24.07 
 
 		 499 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0255781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.36 
 
 		 664 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  21.88 
 
 		 341 aa  44.3  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  28.44 
 
 		 683 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.19 
 
 		 340 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>