19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2396 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  710    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  46.89 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  31 
 
 
361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  30.61 
 
 
344 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  29.24 
 
 
346 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  30.56 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  28.12 
 
 
346 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  28.65 
 
 
386 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1212  hypothetical protein  25.82 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000090453  decreased coverage  1.89634e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  24.93 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  23 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  25.57 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  24.2 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  22.73 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  26.64 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1492  hypothetical protein  23.37 
 
 
378 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.914795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  20.32 
 
 
390 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  24.66 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  22.31 
 
 
376 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>