More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1931 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  100 
 
 
279 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  38.29 
 
 
286 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  42.48 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  39.11 
 
 
286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  38.75 
 
 
286 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  40.22 
 
 
286 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  39.11 
 
 
286 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  37.59 
 
 
286 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  39.62 
 
 
270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  38.01 
 
 
286 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  41.89 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  43.18 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  48.96 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  41.45 
 
 
284 aa  212  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  43.75 
 
 
280 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  37.87 
 
 
275 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  41.48 
 
 
287 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  38.41 
 
 
282 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  39.93 
 
 
281 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  38.49 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  42.51 
 
 
288 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  39.47 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  38.13 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  40.6 
 
 
270 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  39.02 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  37.32 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  33.73 
 
 
267 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  41.48 
 
 
283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  40.74 
 
 
283 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  40.74 
 
 
283 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  37 
 
 
285 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  35.87 
 
 
287 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  43.78 
 
 
280 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  36.23 
 
 
287 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  42.11 
 
 
288 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  34.27 
 
 
275 aa  175  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  38.66 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  42.41 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  35.82 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  38.69 
 
 
291 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  40.24 
 
 
279 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  41.54 
 
 
291 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  41.91 
 
 
290 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  34.41 
 
 
279 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  40.52 
 
 
296 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1141  PHP-like  39.13 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000994847  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0261  phosphotransferase domain-containing protein  37.76 
 
 
270 aa  163  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  41.46 
 
 
284 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  40.87 
 
 
294 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  37.19 
 
 
288 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  39.5 
 
 
293 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  40.16 
 
 
288 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06590  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  42.47 
 
 
295 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366833  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  34.97 
 
 
287 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  37.8 
 
 
292 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  34.16 
 
 
280 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  38.13 
 
 
285 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  39.92 
 
 
293 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  36.14 
 
 
289 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  40.57 
 
 
297 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  40.79 
 
 
285 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  40.49 
 
 
291 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  41.83 
 
 
294 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  32.62 
 
 
314 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  39.43 
 
 
278 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  37.98 
 
 
290 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  39.61 
 
 
286 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  32.26 
 
 
280 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  37.85 
 
 
287 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2507  PHP domain protein  39.45 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000732927 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  40.3 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  42.23 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  40.3 
 
 
295 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  38.15 
 
 
322 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  36.84 
 
 
291 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  38.04 
 
 
288 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  40.8 
 
 
287 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  39.44 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  35.89 
 
 
282 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0704  PHP domain protein  38.34 
 
 
280 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0442  PHP domain protein  34.77 
 
 
321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000416884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  38.34 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  37.4 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  37.4 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5748  PHP domain protein  38.52 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  39.11 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  39.11 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  34.78 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  36.47 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  37.5 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  39.11 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  36.4 
 
 
286 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  37.9 
 
 
290 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0107  putative metal-dependent phosphoesterse  36.4 
 
 
297 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  39.11 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  37.94 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  37.94 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  41.13 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  37.1 
 
 
286 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  38.85 
 
 
281 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>