16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0898 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0898  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  929    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2742  hypothetical protein  45.7 
 
 
476 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1814  hypothetical protein  31.63 
 
 
494 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4860  hypothetical protein  29.13 
 
 
466 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4920  hypothetical protein  30.06 
 
 
506 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404892  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4585  hypothetical protein  27.98 
 
 
498 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152232  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4922  hypothetical protein  29.53 
 
 
513 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.741719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6247  hypothetical protein  30.3 
 
 
499 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.594867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6417  hypothetical protein  29.11 
 
 
501 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00289521  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0051  hypothetical protein  26.28 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.286541  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1887  hypothetical protein  27.97 
 
 
452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.39427  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4587  hypothetical protein  27.59 
 
 
467 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00650998  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10713  hypothetical protein  27.63 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.883584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1976  hypothetical protein  27.71 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.116034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12998  hypothetical protein  25.28 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4586  hypothetical protein  24.64 
 
 
480 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000082424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>