59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3691 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  93.43 
 
 
213 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  64.02 
 
 
214 aa  299  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  59.42 
 
 
219 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  49.76 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  48.28 
 
 
231 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  46.63 
 
 
234 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  46.63 
 
 
234 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  27.41 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  28.87 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  28.77 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  28.3 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  28.44 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  27.78 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  26.77 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  27.32 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  29.11 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  26.79 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  27.36 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  25.59 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  25.26 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  26.06 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  23.74 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  25 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  28.89 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  30.77 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  25.47 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  23.83 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.03 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  27.09 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  25.23 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  24.76 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  25.12 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  23.56 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26.83 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  28.4 
 
 
433 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.67 
 
 
169 aa  58.9  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  23 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  23 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  23 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  24.41 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.57 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  23.74 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  23.35 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  22.66 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  24.63 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  23.87 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  23.87 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  23.87 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  23.87 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  25.34 
 
 
213 aa  52  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.83 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  26.22 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  23.72 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2048  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.62 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.045391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  19.19 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>