More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5899 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  75.96 
 
 		 653 aa  1018    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  100 
 
 		 653 aa  1330    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  36.84 
 
 		 670 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  36.71 
 
 		 669 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  39.64 
 
 		 688 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  36.71 
 
 		 667 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  36.28 
 
 		 671 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  38.31 
 
 		 683 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  39.01 
 
 		 686 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  38.3 
 
 		 699 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  37.87 
 
 		 683 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  38.02 
 
 		 682 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  37.85 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  37.48 
 
 		 678 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  38.41 
 
 		 655 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  36.46 
 
 		 642 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  36.96 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  35.15 
 
 		 671 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  32.43 
 
 		 681 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  32.1 
 
 		 688 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  31.68 
 
 		 675 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  34.92 
 
 		 661 aa  347  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  33.95 
 
 		 660 aa  347  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  32.89 
 
 		 678 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  32.89 
 
 		 678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  31.78 
 
 		 680 aa  326  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  31.43 
 
 		 676 aa  319  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  32.59 
 
 		 662 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  26.65 
 
 		 690 aa  263  8e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  30.23 
 
 		 692 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  28.73 
 
 		 701 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  29.15 
 
 		 689 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  27.45 
 
 		 696 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  29.08 
 
 		 692 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  27.85 
 
 		 697 aa  251  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  26.32 
 
 		 685 aa  250  7e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  29.08 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  28.71 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  28.37 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  29.26 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  28.92 
 
 		 692 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  28.59 
 
 		 692 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  27.3 
 
 		 696 aa  248  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  28.71 
 
 		 693 aa  247  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  29.18 
 
 		 696 aa  247  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  29.19 
 
 		 695 aa  246  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  26.92 
 
 		 694 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  26.63 
 
 		 692 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  29.15 
 
 		 680 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  28.47 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  28.76 
 
 		 692 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  26.15 
 
 		 695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  26 
 
 		 683 aa  243  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  27.86 
 
 		 695 aa  243  7.999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  28.48 
 
 		 691 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  29.85 
 
 		 689 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  28.43 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  28.34 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  28.43 
 
 		 692 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  28.36 
 
 		 670 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  29.35 
 
 		 691 aa  241  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  26.27 
 
 		 685 aa  241  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  27.63 
 
 		 697 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  28.92 
 
 		 691 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  27.94 
 
 		 692 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  28.29 
 
 		 692 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  28.92 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  29.09 
 
 		 673 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  27.59 
 
 		 695 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  28.76 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  28.9 
 
 		 692 aa  238  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  27.86 
 
 		 691 aa  238  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  25.6 
 
 		 683 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  28.12 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.89 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  27.87 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  28.05 
 
 		 683 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  26.28 
 
 		 686 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  28.43 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  28.27 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  28.27 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.01 
 
 		 689 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  28.86 
 
 		 691 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  28.24 
 
 		 704 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  28.3 
 
 		 702 aa  233  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  28.76 
 
 		 690 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  27.94 
 
 		 692 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  27.27 
 
 		 698 aa  232  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0755  elongation factor G  27.19 
 
 		 707 aa  233  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  27.97 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2537  elongation factor G  27.71 
 
 		 705 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0339845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  27.97 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  27.61 
 
 		 692 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  27.61 
 
 		 691 aa  231  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>