16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4400 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2573  TadE family protein  29.82 
 
 
193 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  27.94 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  36.26 
 
 
722 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  34.83 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  36.26 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  36.26 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  27.81 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  20.14 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  34.09 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  31.46 
 
 
177 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  31.46 
 
 
177 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  31.46 
 
 
177 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  27.15 
 
 
177 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  24.81 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4399  TadE family protein  33.33 
 
 
208 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>