20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3227 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  100 
 
 		 125 aa  243  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  84.8 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.23 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  33.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.48 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  27.73 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  34.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.83 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  49.23 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4280  hypothetical protein  30.97 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.83 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3329  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  36.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  32.17 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  24 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  28.57 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3451  DoxX family protein  27.48 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  24.78 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>