38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1502 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  100 
 
 
48 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  93.75 
 
 
48 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  75 
 
 
48 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  77.08 
 
 
48 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  80 
 
 
49 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  74.47 
 
 
48 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  77.08 
 
 
48 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  77.08 
 
 
48 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  75.56 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  72.34 
 
 
48 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  64.58 
 
 
48 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  64.58 
 
 
48 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  64.58 
 
 
52 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  64.58 
 
 
48 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  62.5 
 
 
48 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  64.58 
 
 
52 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  64.44 
 
 
46 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  52.17 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  47.62 
 
 
50 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  55.26 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  42.55 
 
 
51 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  53.85 
 
 
50 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  57.58 
 
 
43 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  45.24 
 
 
50 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  47.62 
 
 
50 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  45.24 
 
 
50 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  45.65 
 
 
50 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2653  hypothetical protein  50 
 
 
47 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  58.82 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1179  hypothetical protein  50 
 
 
47 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  61.11 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0680  hypothetical protein  63.89 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.0280363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  61.11 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  55.88 
 
 
48 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  45.24 
 
 
47 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  45.24 
 
 
47 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>