34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2481 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  80 
 
 		 48 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  80 
 
 		 48 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  76.09 
 
 		 48 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  76.6 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  76.09 
 
 		 48 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  76.09 
 
 		 48 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  71.74 
 
 		 48 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  71.74 
 
 		 48 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  71.74 
 
 		 48 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  62.22 
 
 		 48 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  62.22 
 
 		 48 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  58.7 
 
 		 46 aa  61.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  58.7 
 
 		 48 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  60 
 
 		 48 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0728  hypothetical protein  60 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0682  hypothetical protein  60 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  52.27 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  48.78 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2653  hypothetical protein  44.68 
 
 		 47 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  45.24 
 
 		 50 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  45.24 
 
 		 50 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  46.51 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  42.86 
 
 		 50 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  41.46 
 
 		 51 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1179  hypothetical protein  47.62 
 
 		 47 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  42.86 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1572  hypothetical protein  55.88 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.572982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  40.43 
 
 		 47 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  40.43 
 
 		 47 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  47.22 
 
 		 43 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  55.88 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  46.34 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>