20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4397 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 43 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  90.48 
 
 		 50 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  83.72 
 
 		 50 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  83.33 
 
 		 50 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  83.33 
 
 		 50 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  58.33 
 
 		 51 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  57.58 
 
 		 48 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  51.52 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  57.58 
 
 		 46 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  58.06 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  60.61 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  46.15 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  57.58 
 
 		 48 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4947  hypothetical protein  53.85 
 
 		 65 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  47.22 
 
 		 49 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  57.58 
 
 		 48 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  51.52 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  52.78 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  46.15 
 
 		 50 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3345  hypothetical protein  51.28 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>