22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2727 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2727  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172753  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3167  protein of unknown function DUF1127  94 
 
 		 50 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2772  hypothetical protein  96 
 
 		 50 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.559182  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2771  hypothetical protein  86 
 
 		 50 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4397  hypothetical protein  83.33 
 
 		 43 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  50 
 
 		 46 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  39.58 
 
 		 48 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  45.24 
 
 		 48 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  44.19 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  42.86 
 
 		 48 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  45.24 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  50 
 
 		 48 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  45.83 
 
 		 50 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  47.62 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  47.62 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  45.83 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3291  hypothetical protein  45 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4947  hypothetical protein  58.33 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0273  hypothetical protein  43.59 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0392259  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  35.42 
 
 		 48 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3865  hypothetical protein  47.62 
 
 		 48 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>