15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2023 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  62.79 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  44 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  44.29 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  44.29 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0680  hypothetical protein  42.25 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.0280363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0273  hypothetical protein  36.76 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0392259  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  43.48 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  50 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  47.5 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  48.72 
 
 		 48 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  47.5 
 
 		 46 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  48.72 
 
 		 48 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2496  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.175447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2332  hypothetical protein  46.15 
 
 		 48 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>