15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0768 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0680  hypothetical protein  94.29 
 
 
71 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.0280363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  47.14 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  44.29 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  47.17 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  57.14 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  51.06 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  60 
 
 
48 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  60 
 
 
48 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  53.66 
 
 
48 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  61.11 
 
 
48 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  47.73 
 
 
48 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  51.22 
 
 
48 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  60 
 
 
46 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>