13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0680 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55844  normal  0.0280363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6037  hypothetical protein  94.29 
 
 		 71 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0768  hypothetical protein  94.29 
 
 		 71 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.788294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2773  hypothetical protein  47.14 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.573316  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0580  hypothetical protein  52.83 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0205147  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2023  hypothetical protein  42.25 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.278774  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0418  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  63.89 
 
 		 48 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  53.19 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  62.86 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  62.86 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  63.89 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  60 
 
 		 48 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>