24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0701 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
142 aa  278  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  32.86 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  32.65 
 
 
157 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  33.08 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  30.88 
 
 
318 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  37.33 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  34.52 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  28.06 
 
 
128 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  32.33 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1391  hypothetical protein  33.98 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  33.73 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  30.28 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  37.35 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  33.73 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  33.72 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  29.71 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  34.44 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  29.5 
 
 
138 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  32.31 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>