34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2221 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  291  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  44.17 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  44 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  40.6 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  38.21 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0643  hypothetical protein  33.61 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1085  hypothetical protein  34.82 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  33.07 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  30.66 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  40.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  40.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  28.03 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  40.24 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  40.24 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  40.24 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  40.24 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  40.24 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  40.24 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  33.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  36.49 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  37.66 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  31.17 
 
 		 505 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>