23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0421 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  315  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  66 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  70.93 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  65.35 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  44.92 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  41.61 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  57.89 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  47.47 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  47.47 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  47.47 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  53.33 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  40.22 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  65.79 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  38.95 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  35.96 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  35.96 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6331  hypothetical protein  36.05 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.305549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1652  hypothetical protein  61.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5292  hypothetical protein  61.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1229  hypothetical protein  28.28 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1676  hypothetical protein  34.78 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.381455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>