26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4515 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  296  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  80.52 
 
 
148 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  66 
 
 
160 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  71.43 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  47.71 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  52 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  58.23 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  43.27 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  43.27 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  43.27 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  45.19 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  42.22 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  40.21 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  37.37 
 
 
147 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  67.57 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  37 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  37 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5682  hypothetical protein  33.66 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305094  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6331  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.305549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1229  hypothetical protein  32.43 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1652  hypothetical protein  54.76 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106232  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5292  hypothetical protein  54.76 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  36.79 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6192  hypothetical protein  36.73 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1676  hypothetical protein  32.65 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.381455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  33.56 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>