16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4365 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6192  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1229  hypothetical protein  39.74 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163655  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  35.96 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  51.02 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  56.41 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  34.88 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>