22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1464 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  57.35 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  57.35 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  57.35 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  58.09 
 
 
193 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  48.47 
 
 
162 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  47.77 
 
 
154 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  51.06 
 
 
159 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  53.12 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  43.87 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  46.51 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  48.51 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  42.28 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  52.08 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  47.1 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  34.31 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  34.31 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  35.1 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6331  hypothetical protein  34.78 
 
 
165 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.305549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00336  hypothetical protein  39.62 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6192  hypothetical protein  29.73 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  48.94 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>