20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0147 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  46.01 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  44.36 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  47.37 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  47.37 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  47.37 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  44.04 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  49.4 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  44.9 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  41.91 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  39.04 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  47.19 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  39.87 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  52.08 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  33.03 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  35.85 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  35.85 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1676  hypothetical protein  31.96 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.381455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>