20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2195 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  83.95 
 
 		 162 aa  207  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  60.55 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  60.55 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  60.55 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  59.63 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  57.89 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  45.22 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  46.39 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  45.1 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  59.38 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  53.52 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  67.57 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  37.04 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  39.78 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1652  hypothetical protein  41.94 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5292  hypothetical protein  41.94 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>