23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1652 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5292  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5682  hypothetical protein  43.88 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6331  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.305549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1676  hypothetical protein  37.62 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  36.61 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  36.21 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  56.1 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  55.32 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1133  hypothetical protein  33.05 
 
 		 121 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.132897  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1295  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0610  hypothetical protein  39.22 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0784946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1424  hypothetical protein  30.37 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000396837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3209  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  58.33 
 
 		 137 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0649  hypothetical protein  46.94 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.514048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>