13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1676 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5682  hypothetical protein  52.94 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6331  hypothetical protein  44.71 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.305549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3100  hypothetical protein  44.83 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0610  hypothetical protein  53.33 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0784946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0649  hypothetical protein  55.56 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.514048 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  34.4 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  35.4 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1652  hypothetical protein  47.92 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5292  hypothetical protein  47.92 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  34.04 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  39.66 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>