19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0177 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  362  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  33.73 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.75 
 
 		 368 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  30.26 
 
 		 159 aa  85.1  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  28.95 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  27.33 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  30.19 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  23.95 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  28.66 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  27.63 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  27.56 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  28.29 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  24.68 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  26.49 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3731  hypothetical protein  25.95 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  23.31 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  28.46 
 
 		 523 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  27.69 
 
 		 523 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  22.56 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>