24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5207 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  61.48 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  64.86 
 
 		 267 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  33.57 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  37.62 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.75 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  34.62 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  34.23 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  34.45 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  29.08 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.51 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1843  hypothetical protein  34.18 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  39.13 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  31.75 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  28.44 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  28.3 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>