36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4937 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 334 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  53.11 
 
 		 392 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  52.35 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  49.19 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  52.27 
 
 		 388 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  49.19 
 
 		 347 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  49.19 
 
 		 347 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  46.08 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  47.08 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  48.87 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  45.57 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  45.9 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  37.31 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  41.56 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  39.74 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  42.99 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  37.13 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  36.5 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.11 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  39.43 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  36.59 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  34.69 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  28.86 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.04 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.82 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.15 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.5 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.19 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.19 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  28.7 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  33.33 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.67 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.26 
 
 		 425 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.79 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35 
 
 		 400 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.11 
 
 		 390 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0958645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>