32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4353 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  58.36 
 
 		 720 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 665 aa  1318    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  56.1 
 
 		 699 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  58.62 
 
 		 679 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  66.33 
 
 		 663 aa  838    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  52.37 
 
 		 688 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  52.37 
 
 		 688 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  52.37 
 
 		 688 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.09 
 
 		 671 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  48.69 
 
 		 680 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  43.39 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  60.55 
 
 		 773 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  38.45 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  38.45 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  38.25 
 
 		 600 aa  334  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  27.43 
 
 		 708 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  25.81 
 
 		 683 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  25.63 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.63 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  25.63 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  25.82 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  25.81 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  25.63 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  33.65 
 
 		 683 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25 
 
 		 697 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27 
 
 		 395 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  27.5 
 
 		 698 aa  48.5  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.7 
 
 		 702 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  28.65 
 
 		 360 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.71 
 
 		 359 aa  45.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  29.17 
 
 		 713 aa  43.9  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.91 
 
 		 704 aa  43.9  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>