38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1755 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  250  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  72.28 
 
 
107 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  54.37 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  49.51 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  49.51 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  46.3 
 
 
109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  43.27 
 
 
105 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  42.06 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  36.11 
 
 
108 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  41.75 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  35.58 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  38.05 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  35.92 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  43.37 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  43.37 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  34.26 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  31.43 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  31.43 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  32.35 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  29.91 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  34.55 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  34.55 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  34.55 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  33.96 
 
 
273 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  36.27 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  33.94 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  32.67 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  32.67 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  31.68 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  32.67 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  32.67 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  32.67 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  30.11 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.95 
 
 
433 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  30.95 
 
 
436 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>