32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3968 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  76.02 
 
 		 495 aa  778    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1025    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  53.32 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  28.71 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  25.25 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  27.89 
 
 		 478 aa  93.2  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  30.8 
 
 		 294 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  26.75 
 
 		 420 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  28.09 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  27.13 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  23.03 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  25.97 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  24.77 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  28.86 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  26.91 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  24.67 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  25.09 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  22.83 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  22.44 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  22.29 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  22.44 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  23.15 
 
 		 308 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03787  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  23.12 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  22.05 
 
 		 308 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  21.69 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  23.15 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  22.22 
 
 		 308 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 309 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 		 264 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.08 
 
 		 296 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>