16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0839 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0839  HNH endonuclease  100 
 
 		 380 aa  784    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.126251  hitchhiker  0.00000000857836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0345  hypothetical protein  58.76 
 
 		 372 aa  471  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.215943  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4047  hypothetical protein  39.3 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2304  hypothetical protein  34.24 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03050  hypothetical protein  33.15 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0036  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000264091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  40 
 
 		 560 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  30.89 
 
 		 575 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4415  HNH nuclease  27.43 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.882303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 551 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0313  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0932  HNH nuclease  22.95 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.362218  hitchhiker  0.00171926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  38 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  28.77 
 
 		 535 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 92 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 585 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>