52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0828 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0828  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186144  unclonable  0.000000000749224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4477  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  55.94 
 
 		 263 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657988  decreased coverage  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.35 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.63 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.87 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3612  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.91 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.31 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1550  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.83 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000233242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3546  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.06 
 
 		 127 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1299  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.35 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3000  cbiX protein  29.06 
 
 		 127 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.82 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3840  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.76 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.76 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0314282 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7707  predicted protein  28.07 
 
 		 134 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.095411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0406  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.42 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  22.69 
 
 		 534 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.25 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4741  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.07 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1857  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.64 
 
 		 159 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.86 
 
 		 471 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.91 
 
 		 465 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1350  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  20.61 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.2 
 
 		 128 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1268  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.21 
 
 		 127 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0489933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0032  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.79 
 
 		 127 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1197  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.82 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1588  cbiX domain protein  19.92 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00133885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.71 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.66 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1309  cbiX protein  18.64 
 
 		 251 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1518  cbiX domain protein  19.07 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.91734e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3862  cbiX domain protein  20.34 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.417558  hitchhiker  0.00000756549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1550  CbiX domain-containing protein  19.49 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1310  cbiX protein  18.32 
 
 		 251 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.58 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1692  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.85 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.303188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  20.17 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1482  cbiX domain protein  19.47 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0833138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  17.21 
 
 		 127 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1446  CbiX domain-containing protein  18.22 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1336  CbiX domain-containing protein  18.22 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25 
 
 		 127 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2162  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.84 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  20.17 
 
 		 236 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  20.17 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  20.17 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.13 
 
 		 418 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149908  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.64 
 
 		 132 aa  43.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.48 
 
 		 553 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  20.17 
 
 		 236 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>