21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3168 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1300  ISRSO13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1149  IS13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0465  ISRSO13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3242  ISRSO13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3168  ISRSO13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1484  ISRSO13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286557  normal  0.34915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1864  ISRSO13-transposase protein  100 
 
 		 444 aa  901    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.480787  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1990  ISPpu8, transposase  55.51 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.106664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4318  ISPpu8, transposase  55.51 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2522  ISPpu8, transposase  55.51 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683526  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2218  ISPpu8, transposase  55.51 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2114  ISPpu8, transposase  55.51 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1865  ISPpu8, transposase  55.51 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1080  prevent-host-death protein  30.14 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.435856  normal  0.0706353 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  26.74 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  26.5 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>