17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4318 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1990  ISPpu8, transposase  100 
 
 		 433 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.106664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2114  ISPpu8, transposase  100 
 
 		 433 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2218  ISPpu8, transposase  100 
 
 		 433 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2522  ISPpu8, transposase  100 
 
 		 433 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683526  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4318  ISPpu8, transposase  100 
 
 		 433 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1865  ISPpu8, transposase  100 
 
 		 433 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3168  ISRSO13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1300  ISRSO13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1149  IS13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0465  ISRSO13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3242  ISRSO13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1864  ISRSO13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.480787  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1484  ISRSO13-transposase protein  55.51 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286557  normal  0.34915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1080  prevent-host-death protein  27.51 
 
 		 545 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.435856  normal  0.0706353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  29.63 
 
 		 228 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0196  transposase IS4 family protein  23.96 
 
 		 369 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>