21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1659 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  36.86 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  37.83 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  36.21 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  36.21 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  35.71 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  32.77 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  32.5 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  32 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  29.61 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  33.94 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  28.39 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  29.11 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  29.55 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  30.53 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  33.6 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0046  hypothetical protein  27.52 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00092552 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0069  hypothetical protein  27.52 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0096  hypothetical protein  27.52 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>