12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2286 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  99.7 
 
 
331 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1037  hypothetical protein  31.55 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2098  hypothetical protein  28.06 
 
 
337 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234685  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  26.54 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  27.25 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  26.49 
 
 
338 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4032  hypothetical protein  25.75 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  24.47 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  22.56 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  22.9 
 
 
354 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.142957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>