21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3868 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  75.43 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  53.91 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  52.32 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3879  hypothetical protein  27.62 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  28.23 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  32.54 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3143  hypothetical protein  29.23 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5622  nutrient deprivation-induced protein  27.17 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.227691 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5259  nutrient deprivation-induced protein  29.25 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  34.12 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  26.25 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  34.91 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  27.65 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4200  hypothetical protein  30.82 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00749597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  28.41 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4346  hypothetical protein  24.55 
 
 		 329 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  29.41 
 
 		 407 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  27.27 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  33.64 
 
 		 333 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  26.39 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>