13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0905 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  81.27 
 
 		 659 aa  1117    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 662 aa  1363    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  56.88 
 
 		 593 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  54.32 
 
 		 719 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  79.15 
 
 		 659 aa  1090    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  50.19 
 
 		 586 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  44.65 
 
 		 804 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  45.53 
 
 		 595 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  42.77 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 499 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 554 aa  109  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  22.29 
 
 		 527 aa  88.6  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2784  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 277 aa  46.6  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.006766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>